More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0603 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  68.82 
 
 
266 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  68.97 
 
 
268 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  63.53 
 
 
266 aa  347  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.12 
 
 
266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  62.31 
 
 
262 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.8 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  62.07 
 
 
262 aa  325  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.18 
 
 
266 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  57.41 
 
 
265 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  56.49 
 
 
265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
261 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 
260 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 
266 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
260 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
260 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.21 
 
 
272 aa  262  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.92 
 
 
267 aa  261  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
267 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
278 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.1 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
287 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.84 
 
 
268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.64 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
267 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
257 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
267 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
271 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
259 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
264 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
273 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
273 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.12 
 
 
262 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
260 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
263 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
267 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
260 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
264 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.7 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
263 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 
260 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
268 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
260 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
267 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
280 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
258 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
269 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
267 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
261 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
287 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
258 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.84 
 
 
260 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
267 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
273 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
263 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
264 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  35.2 
 
 
269 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.24 
 
 
263 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
267 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
259 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
265 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
274 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
266 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
263 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
263 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.46 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.11 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.11 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.63 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.46 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
261 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
269 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
260 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>