185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4127 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  96.17 
 
 		 211 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  85.17 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  70.14 
 
 		 211 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  70.62 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  69.67 
 
 		 211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.67 
 
 		 211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  69.67 
 
 		 211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  71.56 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  70.14 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  69.08 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.08 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  53.59 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  53.33 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  53.08 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  53.33 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  55.38 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  43.63 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  44.55 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.57 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  41.95 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.98 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  41.23 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  37.73 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.21 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.5 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  38.86 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.21 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  37.21 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.75 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.67 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.41 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  34 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  38.19 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  38.97 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  42.93 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.24 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.68 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.54 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  37.44 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  33.99 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.99 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.33 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.83 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  34.15 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.94 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.85 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.85 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.82 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.47 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.21 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  29.38 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  31.72 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.96 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.9 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  34.16 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  34.16 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.82 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.32 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.32 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.78 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.21 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.86 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  45.65 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  34.3 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  29.67 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.77 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.77 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  30.23 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.88 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.42 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.71 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.4 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.84 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.71 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  31.82 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  43.3 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  33.68 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  36.84 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  32.2 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  37.27 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  24.87 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  32.35 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  33.02 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  32.35 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.23 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  32.65 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  38.89 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>