More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4271 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
447 aa  911  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  49.43 
 
 
446 aa  416  1e-115  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  46.45 
 
 
454 aa  358  1e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  41.72 
 
 
475 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  40.77 
 
 
440 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  43.2 
 
 
445 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  42.82 
 
 
442 aa  327  4e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  47.42 
 
 
439 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  47.28 
 
 
437 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  47.3 
 
 
437 aa  321  2e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  38.85 
 
 
441 aa  316  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  45 
 
 
437 aa  313  6e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  40.38 
 
 
426 aa  305  9e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  40.14 
 
 
426 aa  305  1e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  41.59 
 
 
434 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  38.61 
 
 
428 aa  285  1e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  38.32 
 
 
454 aa  285  2e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  39.51 
 
 
428 aa  284  3e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  34.62 
 
 
439 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  35.93 
 
 
454 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  37.23 
 
 
444 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  34.62 
 
 
438 aa  274  2e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  37.17 
 
 
451 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 
437 aa  270  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  35.73 
 
 
425 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  38.16 
 
 
447 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.89 
 
 
439 aa  259  5e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  37.82 
 
 
437 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  39.64 
 
 
467 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  36.63 
 
 
436 aa  255  1e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  34.82 
 
 
453 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  36.84 
 
 
441 aa  253  5e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 
455 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 
455 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  35.42 
 
 
445 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  34.45 
 
 
433 aa  249  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  38.35 
 
 
439 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  37.22 
 
 
428 aa  245  1e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  34.13 
 
 
448 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  36.79 
 
 
446 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  32.4 
 
 
439 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  39.12 
 
 
430 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  34.1 
 
 
459 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.14 
 
 
442 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  35.06 
 
 
441 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.33 
 
 
448 aa  220  4e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.81 
 
 
441 aa  220  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  35.07 
 
 
448 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  36.15 
 
 
441 aa  217  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
430 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 
434 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  34.28 
 
 
422 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  32.78 
 
 
440 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  34.28 
 
 
422 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
437 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  33.41 
 
 
440 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  34.7 
 
 
444 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  31.65 
 
 
441 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  33.71 
 
 
445 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  35.96 
 
 
441 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  31.1 
 
 
419 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  1.91252e-09 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  35.45 
 
 
446 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  34.24 
 
 
426 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  33.16 
 
 
437 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  30.36 
 
 
447 aa  203  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  32.86 
 
 
437 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.16 
 
 
423 aa  202  1e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  37.4 
 
 
399 aa  201  2e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  33.09 
 
 
430 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  35.46 
 
 
420 aa  198  1e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.17 
 
 
423 aa  196  5e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.17 
 
 
423 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.17 
 
 
423 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  34.59 
 
 
439 aa  196  8e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  33.74 
 
 
439 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  36.08 
 
 
420 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  29.19 
 
 
418 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.17 
 
 
423 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.59 
 
 
423 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.43 
 
 
453 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  32.92 
 
 
423 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.67 
 
 
423 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.93 
 
 
423 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.18 
 
 
423 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  31.86 
 
 
423 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  31.86 
 
 
423 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.86 
 
 
423 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.86 
 
 
423 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.93 
 
 
423 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  30.91 
 
 
444 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  33.83 
 
 
440 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  33.58 
 
 
440 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 
435 aa  185  1e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  33.58 
 
 
440 aa  184  2e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  32.83 
 
 
440 aa  183  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  30.64 
 
 
434 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  31.4 
 
 
450 aa  174  2e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  33.03 
 
 
420 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  31.16 
 
 
422 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  33.26 
 
 
448 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>