More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5359 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 297 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  60.07 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  33.11 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  34.88 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  27.71 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  35.19 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.72 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.3 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  26.67 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 436 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  29.67 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  32.72 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  30.31 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  28.22 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  27.8 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  27.87 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  27.53 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  27.87 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.24 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27.5 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  25.5 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  35.92 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8442  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  24.82 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>