More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2264 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0088  DNA gyrase subunit A  46.39 
 
 
844 aa  751  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  49.42 
 
 
828 aa  855  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  9.29696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  47.22 
 
 
908 aa  813  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  48.17 
 
 
807 aa  827  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  56.54 
 
 
898 aa  1003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  82.38 
 
 
889 aa  1493  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  92.34 
 
 
878 aa  1623  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
875 aa  1047  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  47.85 
 
 
840 aa  808  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  9.48225e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  91.64 
 
 
859 aa  1612  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2067  DNA gyrase, A subunit  46.94 
 
 
929 aa  751  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0388557  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2042  DNA gyrase subunit A  57.08 
 
 
893 aa  1034  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.430376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  95.96 
 
 
867 aa  1696  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  78.88 
 
 
902 aa  1434  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  8.57491e-07  decreased coverage  3.46296e-25 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0959  DNA gyrase subunit A  78.78 
 
 
885 aa  1435  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2123  DNA gyrase subunit A  56.96 
 
 
893 aa  1033  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4447  DNA gyrase, A subunit  47.51 
 
 
914 aa  809  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.950017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  53.37 
 
 
848 aa  919  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  45.57 
 
 
883 aa  768  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  48.65 
 
 
816 aa  827  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1744  DNA gyrase subunit A  46.56 
 
 
941 aa  786  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494976  normal  0.4202 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  60.11 
 
 
875 aa  1049  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  61.01 
 
 
885 aa  1067  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1016  DNA gyrase, A subunit  58.74 
 
 
845 aa  1032  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  9.44183e-11 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
878 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
878 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  53.74 
 
 
836 aa  946  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4482  DNA gyrase, A subunit  50.06 
 
 
906 aa  840  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  59.88 
 
 
878 aa  1051  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
878 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
878 aa  1056  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  57.84 
 
 
904 aa  1025  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0096  DNA gyrase, A subunit  49.19 
 
 
827 aa  840  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  50.24 
 
 
826 aa  872  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2869  DNA gyrase subunit A  48.25 
 
 
913 aa  840  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  50.18 
 
 
828 aa  876  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  5.07659e-05  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0999  DNA gyrase subunit A  96.24 
 
 
851 aa  1669  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2306  DNA gyrase, A subunit  59.36 
 
 
905 aa  1066  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0379216  hitchhiker  1.00846e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2151  DNA gyrase, A subunit  47.63 
 
 
910 aa  823  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587258  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  53.7 
 
 
830 aa  918  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.24756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  46.48 
 
 
837 aa  765  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2067  DNA gyrase, A subunit  59.48 
 
 
903 aa  1064  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  59.8 
 
 
882 aa  1078  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.14 
 
 
904 aa  1065  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55743e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0843  DNA gyrase subunit A  44.86 
 
 
873 aa  756  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.462106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  60 
 
 
875 aa  1047  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  60.23 
 
 
875 aa  1050  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  60.9 
 
 
878 aa  1069  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  47.31 
 
 
823 aa  758  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  58.87 
 
 
850 aa  1010  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4317  DNA gyrase, A subunit  46.47 
 
 
914 aa  817  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3049  DNA gyrase, A subunit  51.34 
 
 
965 aa  781  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1633  DNA gyrase, A subunit  46.85 
 
 
829 aa  752  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0894525  normal  0.0126179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  60.86 
 
 
897 aa  1066  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4493  DNA gyrase, A subunit  50.7 
 
 
891 aa  841  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0318161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  46.85 
 
 
913 aa  794  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  46.31 
 
 
839 aa  749  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16309e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  46.43 
 
 
827 aa  773  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  58.71 
 
 
923 aa  1071  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  59.89 
 
 
875 aa  1044  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  59.89 
 
 
875 aa  1044  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67679e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  60.86 
 
 
897 aa  1064  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0008  DNA gyrase, A subunit  49.65 
 
 
812 aa  845  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  8.00696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2871  DNA gyrase subunit A  45.84 
 
 
922 aa  779  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236942  normal  0.0392982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  58.13 
 
 
921 aa  1068  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  48.3 
 
 
807 aa  829  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  52.23 
 
 
823 aa  866  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  47.72 
 
 
911 aa  827  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  60.86 
 
 
885 aa  1065  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  58.87 
 
 
848 aa  1011  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2264  DNA gyrase subunit A  100 
 
 
867 aa  1775  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  79.54 
 
 
888 aa  1444  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  45.15 
 
 
899 aa  754  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2404  DNA gyrase, A subunit  59.44 
 
 
916 aa  1068  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00637691  unclonable  1.91603e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  51.75 
 
 
821 aa  863  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11138  DNA gyrase A subunit  47.36 
 
 
848 aa  828  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  61.94 
 
 
864 aa  1110  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  61.22 
 
 
879 aa  1071  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  51.69 
 
 
818 aa  855  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  48.05 
 
 
802 aa  806  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2473  DNA gyrase, A subunit  46.26 
 
 
809 aa  794  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  49.88 
 
 
811 aa  849  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  50 
 
 
820 aa  865  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  49.94 
 
 
932 aa  815  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  48.26 
 
 
901 aa  792  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2730  DNA gyrase, A subunit  45.34 
 
 
819 aa  746  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  47.11 
 
 
848 aa  796  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0006  DNA gyrase, A subunit  45.55 
 
 
814 aa  775  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0624353  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  46.84 
 
 
870 aa  799  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  47.39 
 
 
838 aa  779  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  45.92 
 
 
841 aa  776  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  45.61 
 
 
841 aa  753  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4476  DNA gyrase, A subunit  51.99 
 
 
891 aa  833  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003111  DNA gyrase subunit A  59.62 
 
 
906 aa  1068  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00046231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  50.94 
 
 
853 aa  865  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  46.8 
 
 
870 aa  750  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  46.86 
 
 
834 aa  767  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  46.49 
 
 
831 aa  762  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  48.51 
 
 
788 aa  773  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0305  DNA gyrase, A subunit  47.27 
 
 
846 aa  750  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>