More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2255 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  66.18 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  52.76 
 
 		 215 aa  205  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  54.46 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  54.46 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  54.77 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  53.47 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  52.08 
 
 		 355 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  49.74 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.21 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  46.93 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  42.65 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  52.51 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  47.72 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.22 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.71 
 
 		 209 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  40.88 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  40.88 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  40.49 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.59 
 
 		 457 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  39.88 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  38.18 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  37.5 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.6 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  37.5 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  30.85 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.22 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  30.93 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.74 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.32 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.3 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.81 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  37.41 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.9 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.11 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.53 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.8 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  36.43 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  32.26 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.15 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.19 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  29.26 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.17 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.43 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.24 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.8 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.72 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  33.54 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.44 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  36.18 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.44 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  28.72 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  28.72 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  28.72 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  26.98 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  28.72 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.14 
 
 		 521 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  28.72 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.02 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.98 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.4 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.43 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  28.09 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29.21 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.1 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  34.04 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  27.69 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  31.75 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  31.94 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  29.52 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  29.94 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.98 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  31.67 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.02 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>