More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1068 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 361 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  64.57 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.4 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.12 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.54 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.82 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.39 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.1 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.96 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.01 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.69 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.67 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.67 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.58 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.52 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.1 
 
 		 362 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.52 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.27 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.12 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.45 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.02 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.67 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.97 
 
 		 363 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.82 
 
 		 363 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.16 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.71 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.73 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.86 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.3 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.01 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.75 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.99 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.06 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.38 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  50.56 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  50.56 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 343 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  45.53 
 
 		 456 aa  276  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.16 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.99 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.16 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.12 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.82 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  47.13 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.31 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.43 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.94 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.19 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.09 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.89 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.39 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 341 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 351 aa  262  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.21 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.15 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.01 
 
 		 336 aa  259  7e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  46.85 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.44 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.97 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 333 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.6 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  44.44 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  44.19 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.81 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.87 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>