More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  100 
 
 		 100 aa  199  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  78.64 
 
 		 103 aa  160  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  76 
 
 		 100 aa  157  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  73.74 
 
 		 101 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  76 
 
 		 100 aa  156  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  76.04 
 
 		 107 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  78.95 
 
 		 103 aa  153  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  76.24 
 
 		 101 aa  151  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  72.45 
 
 		 101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  72.28 
 
 		 101 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  72.28 
 
 		 101 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  69 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  71.88 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  69.39 
 
 		 98 aa  137  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  70.33 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  72.53 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  69.23 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  69.79 
 
 		 99 aa  133  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  67.02 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  67.01 
 
 		 100 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  64.21 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  63.16 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  63.16 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  65.22 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  66.3 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  63.44 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  64.21 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  64.21 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  61.7 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  59.6 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  60.82 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  58.76 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.06 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  54.26 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  53.85 
 
 		 93 aa  96.7  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  52.63 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 93 aa  93.2  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  47.83 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  47.92 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.87 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  51.14 
 
 		 98 aa  85.9  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  53.76 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  47.31 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  52.75 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  48.86 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  53.09 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  53.09 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  53.09 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  51.85 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  51.25 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  51.85 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  53.09 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  49.38 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>