More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1885 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
316 aa  647  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  93.04 
 
 
316 aa  613  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  93.35 
 
 
316 aa  613  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  90.51 
 
 
316 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  90.82 
 
 
316 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  90.82 
 
 
316 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  90.51 
 
 
316 aa  597  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  90.51 
 
 
316 aa  597  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  89.87 
 
 
316 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  82.91 
 
 
316 aa  544  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  93.13 
 
 
265 aa  505  1e-142  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  45.94 
 
 
328 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  46.8 
 
 
314 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.35611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  42.22 
 
 
317 aa  268  9e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  42.22 
 
 
317 aa  268  9e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  38.73 
 
 
318 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 
309 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 
317 aa  216  3e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.72 
 
 
514 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  37.35 
 
 
331 aa  201  1e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  34.69 
 
 
315 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  36.39 
 
 
332 aa  199  4e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.71872e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.78 
 
 
515 aa  196  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.78 
 
 
515 aa  196  4e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  35.35 
 
 
304 aa  196  4e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 
307 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.48 
 
 
349 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 
304 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 
318 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.66 
 
 
326 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 
316 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 
314 aa  184  2e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
333 aa  184  2e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  34.36 
 
 
333 aa  178  9e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 
315 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 
321 aa  173  4e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31 
 
 
311 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 
282 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
301 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.48152e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  34.63 
 
 
506 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 
324 aa  165  1e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.71 
 
 
345 aa  162  5e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  34.84 
 
 
313 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 
358 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 
312 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 
311 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  33.55 
 
 
280 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 
312 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30 
 
 
320 aa  156  5e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  29.52 
 
 
298 aa  156  5e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 
331 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.89 
 
 
298 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  32.25 
 
 
307 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.72 
 
 
339 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  32.04 
 
 
306 aa  154  3e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  4.44188e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 
304 aa  153  3e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 
308 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  26.52 
 
 
362 aa  145  7e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 
287 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.21353e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 
292 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
313 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  28.32 
 
 
311 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 
333 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.64 
 
 
292 aa  141  1e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 
294 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 
353 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.0108e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
300 aa  139  4e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.61 
 
 
323 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 
293 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 
300 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.1 
 
 
347 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 
310 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.37 
 
 
294 aa  134  2e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 
310 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.52 
 
 
323 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  33.21 
 
 
302 aa  132  8e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
303 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 
307 aa  131  1e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
311 aa  131  1e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 
302 aa  131  1e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.38 
 
 
290 aa  131  1e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 
296 aa  131  1e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 
333 aa  130  2e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
328 aa  130  4e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.82 
 
 
304 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 
368 aa  128  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
300 aa  128  1e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  26.77 
 
 
313 aa  127  2e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 
323 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 
357 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 
317 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  27.33 
 
 
290 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
306 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  26.5 
 
 
305 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  27.44 
 
 
344 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 
333 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
296 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 
319 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 
277 aa  121  1e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>