More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1290 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  90.66 
 
 
364 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  91.21 
 
 
364 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  91.48 
 
 
364 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  92.58 
 
 
364 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  87.09 
 
 
363 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  91.21 
 
 
364 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
378 aa  760    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  91.78 
 
 
365 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  89.47 
 
 
363 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  90.66 
 
 
364 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  89.47 
 
 
363 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.82 
 
 
350 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  49.15 
 
 
355 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  50.29 
 
 
350 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.66 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.66 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.94 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  44.72 
 
 
368 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.44 
 
 
359 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
366 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
366 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  44.75 
 
 
366 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.67 
 
 
366 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  44.94 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  44.94 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.75 
 
 
359 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.18 
 
 
351 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.05 
 
 
359 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  40.34 
 
 
347 aa  250  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.69 
 
 
346 aa  249  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.67 
 
 
358 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.71 
 
 
354 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.39 
 
 
360 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.39 
 
 
360 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.39 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.38 
 
 
366 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.47 
 
 
365 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.61 
 
 
363 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.66 
 
 
360 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.98 
 
 
356 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.46 
 
 
366 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.32 
 
 
353 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.96 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.55 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.82 
 
 
354 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.1 
 
 
376 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.54 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.83 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.98 
 
 
367 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.9 
 
 
362 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.31 
 
 
361 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.92 
 
 
367 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.36 
 
 
381 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.81 
 
 
366 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.53 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  31.83 
 
 
359 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.47 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 
359 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.04 
 
 
346 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  35.38 
 
 
359 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.67 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  37.25 
 
 
351 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.72 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.92 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.97 
 
 
366 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  37.54 
 
 
351 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.16 
 
 
356 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.16 
 
 
356 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.88 
 
 
349 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.54 
 
 
355 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 
358 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  35.65 
 
 
356 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 
356 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.25 
 
 
351 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.11 
 
 
354 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.4 
 
 
366 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
378 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 
356 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.57 
 
 
358 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.3 
 
 
349 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.59 
 
 
349 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.59 
 
 
349 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.43 
 
 
371 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.9 
 
 
361 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 
353 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.39 
 
 
354 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.81 
 
 
357 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 
354 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 
350 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.76 
 
 
356 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.99 
 
 
377 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  35.76 
 
 
352 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.82 
 
 
366 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.43 
 
 
348 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.04 
 
 
380 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.2 
 
 
356 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>