More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0828 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4885  GntR family transcriptional regulator  93.48 
 
 
491 aa  865  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0828  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
488 aa  974  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  92.92 
 
 
464 aa  847  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3723  transcriptional regulator  88.42 
 
 
520 aa  854  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.577094  normal  0.097742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3481  GntR family transcriptional regulator  93.48 
 
 
491 aa  865  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.679234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5401  transcriptional regulator  93.36 
 
 
470 aa  852  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  92.18 
 
 
485 aa  877  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2663  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.27 
 
 
469 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139501  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2335  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.08 
 
 
470 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.179489  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  62.75 
 
 
483 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.11 
 
 
473 aa  577  1e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  58.9 
 
 
460 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  59.47 
 
 
474 aa  572  1e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  59.08 
 
 
488 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3062  transcriptional regulator  59.34 
 
 
460 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301843  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2948  GntR family transcriptional regulator  57.36 
 
 
460 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216869  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2733  GntR family transcriptional regulator  58.24 
 
 
460 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7210  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  63.52 
 
 
478 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6290  transcriptional regulator  62.81 
 
 
467 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167913  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.52 
 
 
464 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.73 
 
 
464 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48160  Aminotransferase protein  59.87 
 
 
460 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  56.43 
 
 
497 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  58.95 
 
 
464 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1822  GntR family transcriptional regulator  56.83 
 
 
460 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2977  transcriptional regulator GntR family  56.67 
 
 
467 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0913  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.12 
 
 
459 aa  540  1e-152  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656272  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4836  GntR family transcriptional regulator  57.56 
 
 
459 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  54.75 
 
 
459 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0258  GntR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
462 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2063  transcriptional regulator  55.63 
 
 
463 aa  516  1e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569208  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4735  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.42 
 
 
471 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4218  aminotransferase class I and II  57.11 
 
 
471 aa  504  1e-142  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7475  GntR family transcriptional regulator  56.37 
 
 
484 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  42.13 
 
 
458 aa  357  3e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
461 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2384  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
486 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2114  transcriptional regulator  39.71 
 
 
489 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0954  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
484 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1949  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1166  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0288  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1317  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1157  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1004  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.315502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0860  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 
484 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.17 
 
 
492 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684396  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0591  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
464 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.04 
 
 
517 aa  344  3e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5687  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
486 aa  343  3e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2266  transcriptional regulator  39.22 
 
 
488 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0931  transcriptional regulator  39.79 
 
 
486 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2369  transcriptional regulator  40.54 
 
 
486 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0989  putative transcription regulator protein  40.47 
 
 
490 aa  343  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0613071  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2542  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
474 aa  342  6e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0371084  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1736  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
486 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2348  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
486 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3172  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
474 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30806  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2037  transcriptional regulator  39.27 
 
 
474 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
467 aa  339  6e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2213  transcriptional regulator  38.74 
 
 
474 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157881  normal  0.27822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2507  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
515 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3330  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
484 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1215  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.43 
 
 
486 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2343  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
512 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
466 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.86 
 
 
472 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262075  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.43 
 
 
472 aa  328  2e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.43 
 
 
472 aa  328  2e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
494 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2911  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
471 aa  323  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0548  transcriptional regulator  40.18 
 
 
470 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2629  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
463 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1834  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.91 
 
 
467 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4694  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.84 
 
 
469 aa  315  1e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1175  transcriptional regulator  38.68 
 
 
468 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3668  transcriptional regulator  41.34 
 
 
509 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22591  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0247  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
482 aa  306  5e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0204  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
481 aa  303  6e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3072  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
455 aa  302  8e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536959  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  38.15 
 
 
471 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4272  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 
467 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200991  normal  0.884881 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.66 
 
 
467 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.340395 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3504  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
461 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4014  transcriptional regulator  38.19 
 
 
461 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920353  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  36.4 
 
 
472 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0288  transcriptional regulator  38.34 
 
 
468 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0671  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
471 aa  284  3e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.47 
 
 
517 aa  283  7e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4341  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.95 
 
 
471 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.86952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4325  transcriptional regulator GntR  36.99 
 
 
446 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4775  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  36.38 
 
 
446 aa  275  2e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0183  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
474 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214272  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1148  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
446 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.976845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1109  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
446 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4469  transcriptional regulator  35.95 
 
 
469 aa  270  6e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4304  transcriptional regulator  35.81 
 
 
446 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4193  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
466 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3115  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.6 
 
 
485 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3842  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
485 aa  262  9e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>