More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0028 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0028  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0543061  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0031  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.56 
 
 
253 aa  213  3e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  36.55 
 
 
254 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  36.55 
 
 
254 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  36.55 
 
 
289 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
248 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
256 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
255 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  43.78 
 
 
261 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
262 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
269 aa  155  5e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
248 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
251 aa  154  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
254 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.96 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
247 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
257 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  36.55 
 
 
254 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
254 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
274 aa  151  9e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
247 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
255 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.74 
 
 
252 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
250 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.04 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
254 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
249 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
263 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.59 
 
 
246 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
275 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
263 aa  148  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
269 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  34.14 
 
 
254 aa  147  1e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
280 aa  147  1e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
244 aa  147  1e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
253 aa  148  1e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
248 aa  146  2e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.36759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
247 aa  147  2e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
257 aa  147  2e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.65 
 
 
248 aa  147  2e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1271  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.63 
 
 
260 aa  147  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.668655  normal  0.576279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
246 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
246 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  35.37 
 
 
254 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
244 aa  145  4e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  145  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  145  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  34.96 
 
 
254 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  34.96 
 
 
254 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
257 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  34.96 
 
 
254 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
260 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 
248 aa  145  9e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
257 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.34 
 
 
245 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  34.55 
 
 
254 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 
246 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  34.55 
 
 
254 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
252 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.32 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  34.55 
 
 
254 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
262 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  35.89 
 
 
255 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
254 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  34.55 
 
 
254 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
262 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
255 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31904e-06  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
275 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
270 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
256 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
262 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
246 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  34.55 
 
 
254 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 
247 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
246 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0604  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
249 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.56681e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
245 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
246 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
244 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
255 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.4 
 
 
250 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
268 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.92 
 
 
246 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
248 aa  142  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
280 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
249 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1581  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.48 
 
 
249 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00017269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  36 
 
 
254 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
249 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
254 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.534322  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
245 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
266 aa  141  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
250 aa  141  1e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>