More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0087 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
485 aa  995  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.36948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  91.75 
 
 
485 aa  897  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
485 aa  996  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.57939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
485 aa  996  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.72568e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
485 aa  996  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  9.37191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
485 aa  996  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.96162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 
484 aa  666  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
491 aa  680  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 
484 aa  666  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
486 aa  703  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
485 aa  996  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.68632e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  97.94 
 
 
491 aa  943  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.69227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  98.56 
 
 
491 aa  983  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.14653e-06  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  99.59 
 
 
491 aa  994  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 
484 aa  674  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  95.88 
 
 
485 aa  929  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.67432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
499 aa  544  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.20471e-10  hitchhiker  3.82568e-09 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
484 aa  518  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
482 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
485 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
484 aa  506  1e-142  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
483 aa  497  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
498 aa  491  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
488 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
488 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
485 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
498 aa  478  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
482 aa  461  1e-128  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
494 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
490 aa  446  1e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
501 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.96599e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
494 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
483 aa  437  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
481 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
490 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
464 aa  424  1e-117  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
490 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
477 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
478 aa  417  1e-115  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
493 aa  407  1e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
473 aa  399  1e-110  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
469 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
479 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
469 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
491 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
501 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
488 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
482 aa  390  1e-107  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
469 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
492 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
481 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
484 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
500 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.83 
 
 
495 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
481 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  4.48328e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
481 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
488 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
487 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
496 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
881 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  41.05 
 
 
546 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
507 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
483 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41.33 
 
 
518 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
464 aa  363  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
484 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
495 aa  362  7e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
504 aa  362  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
482 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
481 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
506 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
465 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
492 aa  358  8e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
494 aa  359  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
504 aa  358  1e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
502 aa  357  3e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
504 aa  357  4e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
466 aa  355  8e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.43347e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
472 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.4771e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
483 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
504 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.91371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
480 aa  353  3e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
502 aa  353  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
504 aa  352  6e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.51622e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
468 aa  352  9e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
469 aa  352  9e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
470 aa  352  9e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
502 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
503 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
498 aa  350  2e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
465 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  8.04672e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
493 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
466 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>