More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6732 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  100 
 
 
165 aa  330  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  77.78 
 
 
162 aa  256  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  73.33 
 
 
162 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  76.1 
 
 
159 aa  243  1e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  59.26 
 
 
162 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  59.87 
 
 
157 aa  182  2e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  46.88 
 
 
179 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  47.02 
 
 
160 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  45.7 
 
 
158 aa  137  5e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  42.07 
 
 
164 aa  131  4e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  44.83 
 
 
163 aa  127  5e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.25 
 
 
170 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.81 
 
 
169 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.89 
 
 
162 aa  120  1e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  37.84 
 
 
171 aa  118  4e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.81 
 
 
163 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  37.42 
 
 
164 aa  116  1e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  37.58 
 
 
173 aa  115  2e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.48 
 
 
164 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  39.57 
 
 
164 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  37.13 
 
 
185 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  33.95 
 
 
167 aa  112  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.89 
 
 
185 aa  112  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  37.06 
 
 
163 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  36.67 
 
 
161 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  35.86 
 
 
161 aa  111  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  38.71 
 
 
164 aa  111  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.17 
 
 
178 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  38.62 
 
 
181 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
164 aa  108  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.21 
 
 
164 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.42 
 
 
157 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.72 
 
 
164 aa  107  8e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  38.73 
 
 
175 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  35.85 
 
 
160 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.95 
 
 
179 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  38.03 
 
 
156 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  34.42 
 
 
170 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  34.32 
 
 
194 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  33.1 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  37.23 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.56 
 
 
178 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  36.23 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  37.06 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  35.33 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  37.14 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  35.51 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.99 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  35.33 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.78 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.62 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.62 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  34.04 
 
 
184 aa  94.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.62 
 
 
161 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  37.06 
 
 
162 aa  94  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  33.56 
 
 
185 aa  94  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.87 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  32.43 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.04 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  37.06 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  34.78 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.33 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  34.67 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  39.06 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.17 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.62 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  37.06 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  31.41 
 
 
185 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.36 
 
 
162 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.37 
 
 
161 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  33.56 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  34.31 
 
 
155 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  33.76 
 
 
194 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  33.76 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.62 
 
 
163 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.64 
 
 
163 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.33 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.62 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.64 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  31.69 
 
 
162 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  36.73 
 
 
162 aa  90.9  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.91 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.78 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.91 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.91 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.94 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.21 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  31.51 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  35.51 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  35.06 
 
 
162 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>