More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5281 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1283    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  40.09 
 
 
678 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  37.08 
 
 
629 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  37.24 
 
 
647 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  36.54 
 
 
629 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  36.35 
 
 
647 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  34.35 
 
 
632 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.38 
 
 
635 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.05 
 
 
639 aa  267  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  35.59 
 
 
667 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  33.94 
 
 
695 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  36.47 
 
 
660 aa  246  9e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  30.9 
 
 
679 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  34.4 
 
 
630 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.46 
 
 
629 aa  237  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  32.9 
 
 
665 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  32.51 
 
 
695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  33.93 
 
 
662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.54 
 
 
673 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.08 
 
 
656 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.75 
 
 
662 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.84 
 
 
640 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.26 
 
 
642 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  33.13 
 
 
656 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.71 
 
 
660 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  32.61 
 
 
645 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  31.88 
 
 
645 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  30.89 
 
 
628 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.39 
 
 
695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  30.45 
 
 
636 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.51 
 
 
671 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.5 
 
 
635 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  35.45 
 
 
665 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  31.13 
 
 
662 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  41.03 
 
 
643 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  33.12 
 
 
654 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  33.18 
 
 
637 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  32.36 
 
 
627 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  33.03 
 
 
679 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  27.27 
 
 
652 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  39.35 
 
 
691 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  35.13 
 
 
684 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  33.75 
 
 
675 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.98 
 
 
660 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  29.12 
 
 
690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.38 
 
 
634 aa  201  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.16 
 
 
690 aa  200  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  30.8 
 
 
660 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.27 
 
 
658 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.78 
 
 
616 aa  200  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.64 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  27.13 
 
 
626 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  30.63 
 
 
683 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  36.26 
 
 
651 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.9 
 
 
658 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  30.83 
 
 
615 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  34.42 
 
 
690 aa  180  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  40.44 
 
 
759 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  28.55 
 
 
647 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  34.62 
 
 
690 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.79 
 
 
720 aa  165  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  30.7 
 
 
614 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  35.37 
 
 
642 aa  161  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  25.23 
 
 
658 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  30.23 
 
 
638 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.11 
 
 
658 aa  157  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.37 
 
 
777 aa  157  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.45 
 
 
657 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  28.61 
 
 
675 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.15 
 
 
711 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  27.38 
 
 
675 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.06 
 
 
657 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  27.11 
 
 
675 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.08 
 
 
688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.21 
 
 
598 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  25.51 
 
 
622 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  33.33 
 
 
716 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  29.67 
 
 
685 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  29.34 
 
 
583 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  36.66 
 
 
726 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  36.66 
 
 
726 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.98 
 
 
681 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  36.66 
 
 
726 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  27.2 
 
 
742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  31.75 
 
 
625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  35.71 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.52 
 
 
632 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.34 
 
 
603 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.75 
 
 
715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.5 
 
 
675 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  25.64 
 
 
676 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  27.08 
 
 
682 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  25.86 
 
 
690 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  28.66 
 
 
760 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01286  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.1 
 
 
344 aa  132  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.11 
 
 
671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  28.7 
 
 
725 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2610  acyltransferase 3  27.67 
 
 
555 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.11 
 
 
604 aa  126  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.11 
 
 
604 aa  126  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>