112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2723 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  66.45 
 
 
520 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  69.76 
 
 
503 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  68.33 
 
 
536 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  68.53 
 
 
519 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  66.15 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  34.92 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  33.88 
 
 
503 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  32.43 
 
 
588 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  31.84 
 
 
493 aa  186  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  30.25 
 
 
575 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  42.59 
 
 
568 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  60 
 
 
537 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  29.64 
 
 
418 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  28.07 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  29.37 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  47.37 
 
 
361 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  49.22 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  49.22 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  48 
 
 
344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  47.06 
 
 
330 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  47.97 
 
 
349 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  50.41 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.81 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.88 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
215 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  46.34 
 
 
264 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 
247 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.7 
 
 
187 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.13 
 
 
257 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.44 
 
 
253 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.82 
 
 
243 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.44 
 
 
251 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.98 
 
 
270 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.21 
 
 
260 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.88 
 
 
183 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.9 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.86 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.53 
 
 
209 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.16 
 
 
210 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35 
 
 
250 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.24 
 
 
212 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.66 
 
 
270 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.16 
 
 
214 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.11 
 
 
144 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.02 
 
 
184 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.16 
 
 
214 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.71 
 
 
326 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.48 
 
 
413 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5983  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.538368  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.11 
 
 
219 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.69 
 
 
216 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.8 
 
 
291 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  28.36 
 
 
514 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.11 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.36 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.95 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.11 
 
 
303 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1022  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
411 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.575167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  29.03 
 
 
507 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.93 
 
 
376 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.15 
 
 
253 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.09 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
273 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.58 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0855  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
541 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.914763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  32.8 
 
 
186 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.11 
 
 
289 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0846  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.75 
 
 
559 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.203875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  30.53 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.6 
 
 
186 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.17 
 
 
281 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.77 
 
 
332 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
345 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.62 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.23 
 
 
283 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
397 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
295 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1745  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0385777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  27.2 
 
 
253 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  30 
 
 
521 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  30.23 
 
 
266 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.09 
 
 
142 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  32 
 
 
186 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.2 
 
 
253 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.23 
 
 
181 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>