189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1255 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  67.46 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  67.46 
 
 		 197 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  66.67 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  61.98 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  58.27 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  60.8 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  60.33 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  56.25 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  52.94 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  49.22 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  46.09 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  48.44 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  45.31 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  42.76 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  47.11 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  45.24 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  44.26 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  44.72 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  42.55 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  45.8 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  44.72 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  49.18 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  46.28 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  45.45 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  47.93 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  41.8 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  42.97 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  45.08 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  36.96 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  42.15 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  39.84 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  37.7 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  38.28 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  34.75 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  34.11 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  30.17 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  38 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0564  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  30.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  28.35 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  35 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  30.23 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  29.27 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  35.58 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>