170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  100 
 
 		 530 aa  1063    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  51.39 
 
 		 537 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.27 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.33 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.32 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.33 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.12 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  37.02 
 
 		 546 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 563 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.88 
 
 		 563 aa  289  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  50.18 
 
 		 318 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 560 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  34.71 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 526 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.58 
 
 		 598 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.94 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 560 aa  246  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.25 
 
 		 559 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.69 
 
 		 549 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.28 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  28.34 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 672 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.9 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  31.47 
 
 		 811 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  26.61 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  31.59 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  39.51 
 
 		 611 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.51 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  31.05 
 
 		 606 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  30.68 
 
 		 718 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  32.58 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.09 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  30.65 
 
 		 616 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  30.84 
 
 		 615 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 556 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  30.52 
 
 		 615 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 716 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  34.03 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  30.52 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 646 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.41 
 
 		 648 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  30.33 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  35.54 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  35.54 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  29.94 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 		 629 aa  200  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  28.76 
 
 		 563 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  32.22 
 
 		 702 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.74 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.06 
 
 		 571 aa  199  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.53 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  38.03 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  38.11 
 
 		 613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  38.03 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  38.03 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.48 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  32.69 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.56 
 
 		 670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.62 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  30.18 
 
 		 607 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  30.93 
 
 		 536 aa  196  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  30.06 
 
 		 575 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 730 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 654 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.87 
 
 		 521 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.53 
 
 		 724 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 544 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  33.63 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  30.28 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.94 
 
 		 625 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.23 
 
 		 602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.23 
 
 		 458 aa  190  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.25 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.94 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.96 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  36.14 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.31 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.32 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.74 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 624 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>