More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  100 
 
 
424 aa  841    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  67.41 
 
 
413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  71.46 
 
 
413 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  70.72 
 
 
413 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  67.57 
 
 
440 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  71 
 
 
411 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  68.25 
 
 
440 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  69.61 
 
 
411 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  70.22 
 
 
413 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  68.24 
 
 
413 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.55 
 
 
412 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.65 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
412 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
412 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
412 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.33 
 
 
412 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  57.4 
 
 
412 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.4 
 
 
412 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
412 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
451 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.66 
 
 
412 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  59.39 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  59.39 
 
 
417 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  58.44 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  59.08 
 
 
412 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.94 
 
 
425 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  58.93 
 
 
405 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  58.93 
 
 
405 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.66 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.69 
 
 
416 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.95 
 
 
407 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  55.14 
 
 
411 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  55.14 
 
 
411 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.48 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.89 
 
 
415 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  53.18 
 
 
401 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.68 
 
 
413 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.67 
 
 
401 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.75 
 
 
415 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  52.9 
 
 
414 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.63 
 
 
411 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.29 
 
 
402 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.13 
 
 
429 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  47.19 
 
 
422 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.27 
 
 
420 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.05 
 
 
393 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  50.63 
 
 
406 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.05 
 
 
393 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.54 
 
 
393 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  48.2 
 
 
420 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.42 
 
 
397 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  47.74 
 
 
414 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  51.04 
 
 
405 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.93 
 
 
417 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.51 
 
 
434 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.96 
 
 
418 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.06 
 
 
426 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.24 
 
 
410 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.08 
 
 
403 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  51.39 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.14 
 
 
419 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.84 
 
 
405 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  52.45 
 
 
420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.8 
 
 
418 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.05 
 
 
392 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  49.1 
 
 
433 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  49.14 
 
 
419 aa  346  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.78 
 
 
404 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.78 
 
 
400 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.78 
 
 
404 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 
400 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  48.77 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 
425 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.42 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.75 
 
 
425 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.85 
 
 
413 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.12 
 
 
395 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.78 
 
 
395 aa  296  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.02 
 
 
413 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.44 
 
 
410 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.63 
 
 
412 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.14 
 
 
398 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  43.39 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.39 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.89 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.16 
 
 
415 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  42 
 
 
403 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.8 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.8 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.8 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.99 
 
 
451 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.62 
 
 
400 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.33 
 
 
412 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.78 
 
 
409 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.78 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.87 
 
 
405 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.87 
 
 
405 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>