More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3261 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  72.52 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  73.18 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  72.88 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  62.54 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  62.54 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  62.19 
 
 		 302 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  54.74 
 
 		 295 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  58.52 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  57.72 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  54.3 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  55.39 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  58.65 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  57.09 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  55.76 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  56.13 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  52.11 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  48.76 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  50.54 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  51.28 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  51.65 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  45.17 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  51.65 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  43.57 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  41.07 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  40.98 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  40.7 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  39.01 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  41.97 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  41.94 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  42.29 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  43.61 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  41.51 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 330 aa  188  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  40.7 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  40.52 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 285 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  36.49 
 
 		 376 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  36.6 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  31.36 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  32.58 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.51 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  33.08 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  33.58 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  33.58 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  33.21 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  31.93 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  31.34 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  32.83 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  32.09 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.34 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.83 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  31.34 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  35.56 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.9 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>