83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1969 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  46.99 
 
 
169 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  46.75 
 
 
177 aa  130  1e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  37.43 
 
 
201 aa  128  4e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  44.87 
 
 
186 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  41.42 
 
 
194 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  41.42 
 
 
194 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  41.42 
 
 
194 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  37.43 
 
 
194 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  40.83 
 
 
194 aa  119  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  41.98 
 
 
196 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  41.98 
 
 
196 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  45.45 
 
 
189 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  37.5 
 
 
190 aa  117  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  36.59 
 
 
220 aa  112  4e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  36.59 
 
 
220 aa  112  4e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  36.99 
 
 
514 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  43.33 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  35.9 
 
 
562 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  38.42 
 
 
199 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  36.55 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  36.55 
 
 
165 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  29.29 
 
 
197 aa  78.2  7e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  41.86 
 
 
172 aa  77  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  32.89 
 
 
174 aa  69.3  3e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  34.19 
 
 
189 aa  65.5  5e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  32.86 
 
 
220 aa  65.1  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  31.58 
 
 
203 aa  63.9  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  31.21 
 
 
248 aa  63.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  30.57 
 
 
215 aa  62.8  3e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  30.87 
 
 
215 aa  62.4  5e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  32.6 
 
 
233 aa  62  5e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  30.71 
 
 
240 aa  61.6  7e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  35.25 
 
 
159 aa  61.6  7e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  30.99 
 
 
190 aa  60.8  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  29.79 
 
 
235 aa  60.1  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  32.06 
 
 
244 aa  60.5  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  27.81 
 
 
221 aa  58.5  6e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  27.81 
 
 
221 aa  58.5  6e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  29.75 
 
 
506 aa  58.5  6e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  34.5 
 
 
243 aa  57.4  1e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  26.67 
 
 
177 aa  57  2e-07  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  33.55 
 
 
248 aa  56.2  3e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  25.15 
 
 
177 aa  56.2  3e-07  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  29.8 
 
 
219 aa  55.8  4e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  34.78 
 
 
183 aa  55.5  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  31.76 
 
 
177 aa  55.5  5e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  23.33 
 
 
177 aa  54.7  8e-07  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  29.44 
 
 
228 aa  53.9  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  31.39 
 
 
184 aa  53.9  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  32.09 
 
 
157 aa  54.3  1e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  27.5 
 
 
231 aa  53.5  2e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  30.43 
 
 
233 aa  53.1  2e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  30.08 
 
 
222 aa  53.5  2e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  30.08 
 
 
222 aa  53.5  2e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  32.33 
 
 
156 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  32.33 
 
 
156 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  30.07 
 
 
233 aa  52.4  4e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  28.57 
 
 
240 aa  52  6e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  26.14 
 
 
177 aa  52  6e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  28.39 
 
 
239 aa  51.6  8e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  24.84 
 
 
177 aa  50.8  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  33.09 
 
 
205 aa  50.1  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  33.1 
 
 
185 aa  50.4  2e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  32.58 
 
 
144 aa  49.7  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  25 
 
 
216 aa  49.3  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5507  peptidase U35 phage prohead HK97  30.61 
 
 
196 aa  49.3  4e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  25 
 
 
216 aa  48.5  6e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  29.29 
 
 
186 aa  48.5  7e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  33.09 
 
 
149 aa  48.1  9e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  31.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  31.03 
 
 
250 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  29.93 
 
 
228 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  33.1 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  33.1 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  32.35 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  26.51 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  27.82 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  24.49 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  30.94 
 
 
167 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  30 
 
 
187 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  35.11 
 
 
139 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  29.94 
 
 
371 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>