227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0605 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  100 
 
 
584 aa  1188    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  75.38 
 
 
584 aa  919    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  68.27 
 
 
609 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  77.26 
 
 
584 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  75.13 
 
 
580 aa  902    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  61.74 
 
 
581 aa  743    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  61.74 
 
 
581 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  51.21 
 
 
581 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  51.79 
 
 
584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  51.46 
 
 
582 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  51.01 
 
 
589 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  51.3 
 
 
585 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  44.16 
 
 
671 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  39.46 
 
 
585 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  39.46 
 
 
585 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  37.99 
 
 
575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  38.12 
 
 
575 aa  353  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  30.99 
 
 
663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  35.71 
 
 
689 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  32.02 
 
 
467 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 
464 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 
464 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  33.14 
 
 
468 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  33.27 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  33.82 
 
 
463 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.2 
 
 
466 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  32.05 
 
 
471 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  31.43 
 
 
485 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.4 
 
 
467 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  31.22 
 
 
485 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  30.99 
 
 
478 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  31.64 
 
 
486 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
480 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  31.41 
 
 
489 aa  161  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  31.61 
 
 
557 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  32.23 
 
 
478 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
518 aa  160  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  30.83 
 
 
483 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  36.22 
 
 
474 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  36.22 
 
 
474 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  31.04 
 
 
509 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  35.97 
 
 
436 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  31.04 
 
 
479 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  28.86 
 
 
548 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  30.21 
 
 
577 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  30.84 
 
 
476 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  31.04 
 
 
476 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  31.04 
 
 
476 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  34.6 
 
 
426 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  32.83 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  32.87 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  35.69 
 
 
547 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  33.02 
 
 
541 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  32.58 
 
 
471 aa  146  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
505 aa  146  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 
568 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.32 
 
 
471 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  33.97 
 
 
471 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  32.58 
 
 
471 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  33.7 
 
 
471 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  32.32 
 
 
471 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  32.32 
 
 
471 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  33.64 
 
 
536 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  35.77 
 
 
468 aa  144  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  33.52 
 
 
454 aa  143  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  28 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  30.35 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  27.88 
 
 
498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  27.88 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  31.73 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  27.88 
 
 
498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  27.88 
 
 
498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  28.35 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.81 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
525 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  29.11 
 
 
527 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  28.16 
 
 
498 aa  140  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
481 aa  140  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
498 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
502 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  32.56 
 
 
388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  29 
 
 
496 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  31.34 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  31.06 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  32.76 
 
 
545 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  27.93 
 
 
568 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  31.82 
 
 
475 aa  135  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  32.76 
 
 
545 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  32.76 
 
 
545 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  27.09 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>