62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0315 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  71.59 
 
 		 179 aa  254  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  76.35 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  66.05 
 
 		 183 aa  234  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  59.35 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  59.35 
 
 		 245 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  60.26 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  60.51 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  48.98 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  51.72 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  50.67 
 
 		 239 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  47.56 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  51.32 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  47.59 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  42.51 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  45.39 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  43.21 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  45.39 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  44.83 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  44.58 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  46.1 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  47.06 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  43.9 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  46.38 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  42.68 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  42.68 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  40.28 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  45.21 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  38.36 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  38.36 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  37.67 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  36.53 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  38.56 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  37.65 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  36.6 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  36.91 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  36.17 
 
 		 160 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  35.51 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  35.37 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  38.33 
 
 		 113 aa  94.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  29.77 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  28.92 
 
 		 367 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  34.56 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  25.15 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  32.82 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  32.82 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  25 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  25.66 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  32.28 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  25.53 
 
 		 532 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  26.43 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 536 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  27.36 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.3 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 556 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  24.82 
 
 		 532 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  24.81 
 
 		 391 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  29.57 
 
 		 459 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.87 
 
 		 815 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>