61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4125 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  60.93 
 
 		 192 aa  207  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  60.26 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  55.09 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  54.32 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  58 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  51.14 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  51.48 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  49.71 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  59.06 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  57.33 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  53.68 
 
 		 137 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  48.82 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  48.82 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  53.85 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  46.41 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  53.59 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  53.59 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  43.43 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  53.59 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  48.07 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  40.76 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  49.66 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  45.51 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  41.29 
 
 		 239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  36.52 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  36.46 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  41.84 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  41.04 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  40.7 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  39.01 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  39.01 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  39.01 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  41.3 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  37.59 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  34.03 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  36.43 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  34.29 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  40.52 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  45.78 
 
 		 367 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  26.38 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  29.75 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  27.21 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  29.25 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  27.07 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  27.07 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  30.43 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  28.38 
 
 		 348 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  29.01 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 348 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  24.64 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  22.7 
 
 		 424 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.93 
 
 		 348 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.09 
 
 		 348 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.83 
 
 		 616 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>