60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2176 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  82.22 
 
 		 190 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  55.62 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  62.75 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  59.35 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  56.77 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  57.32 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  52.3 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  54.55 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  46.45 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  45.14 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  43.93 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  49.09 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  48.97 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  48.61 
 
 		 174 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  51.3 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  45.61 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  51.7 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  48.98 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  47.62 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  51.02 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  51.02 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  41.21 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  44.83 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  45.28 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  47.45 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  43.84 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  39.29 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  39.29 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  39.01 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  36.76 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  35.9 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  40.69 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  39.01 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  40.3 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  34.03 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  40.34 
 
 		 113 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  34.09 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  35.97 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  28.24 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  46.58 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  31.5 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  34.43 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  32.33 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  24.59 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  31.07 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  29.36 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  30.99 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 245 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 532 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  27.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  24.62 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  24.62 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.09 
 
 		 815 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 532 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.49 
 
 		 616 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>