40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0614 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  43.97 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  44.96 
 
 		 162 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  40.69 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  36.15 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  27.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  29.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  28.78 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  28.78 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  28.08 
 
 		 194 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  30.99 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  28.95 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  34.95 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  29.5 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  25.78 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  35.35 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  31.07 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  27.03 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  32.04 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  27.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  27.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  33.01 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  30.1 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  28.7 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  28.3 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  27.27 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  29.36 
 
 		 245 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  29.13 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  29.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  32.32 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  26.24 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  27.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  26.19 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.61 
 
 		 391 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  26.72 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  28.16 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  26.73 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>