48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4584 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  42.14 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  40.69 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  40.69 
 
 		 245 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  40.48 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  37.86 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  37.13 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  34.67 
 
 		 199 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  36.57 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  39.58 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  37.91 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  37.12 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  36.71 
 
 		 197 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  36.54 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  35.43 
 
 		 204 aa  97.1  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  36.08 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  36.08 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  34.52 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  35.77 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  30.22 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  31.82 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  34.33 
 
 		 200 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  33.82 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  33.33 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  34.29 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  35.04 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  33.33 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  35.77 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  34.04 
 
 		 239 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  32.19 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  31.2 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  30.63 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  32.61 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  32.58 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  30.15 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  27.81 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  36.36 
 
 		 367 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0664  hypothetical protein  27.48 
 
 		 251 aa  40.8  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0762495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  29.08 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>