51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1125 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  44.96 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  42.55 
 
 
141 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  35.76 
 
 
165 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  32.81 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  28.68 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  28.68 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  35.35 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  28.57 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  28.22 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  28.91 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  29.69 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  24.24 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  30.47 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  27.63 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  25.66 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  27.81 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  27.81 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  26.09 
 
 
113 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  30.63 
 
 
191 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  52  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  34.74 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  27.61 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  29.77 
 
 
192 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  30.47 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  25.85 
 
 
187 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  29.73 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  29.25 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  29.46 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  24.59 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  32.69 
 
 
190 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  26.4 
 
 
186 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  30.22 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  25.56 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  23.23 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  27.43 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  29.01 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  24.63 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  27.88 
 
 
245 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  24 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  26.73 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  27.88 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  27.78 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  26.8 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  28.36 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  28.23 
 
 
292 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>