35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0258 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  323  8.000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  29.2 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  31.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  25.3 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  27.82 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  27.82 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  29.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  29.29 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  26.62 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  26.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  25.71 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  24.24 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 		 751 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  25.36 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  24.24 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  28.71 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  22.9 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  25.97 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  23.48 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  21.66 
 
 		 424 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  36.51 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.91 
 
 		 907 aa  44.7  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  27.18 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  22.3 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  31.37 
 
 		 324 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29 
 
 		 448 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.63 
 
 		 474 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  25.33 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  26.09 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  22.9 
 
 		 200 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  21.58 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  22.66 
 
 		 296 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  21.58 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>