55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0379 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  79.9 
 
 		 194 aa  290  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  73.68 
 
 		 187 aa  248  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  75.32 
 
 		 197 aa  240  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  73.42 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  73.42 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  64.97 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  64.05 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  49.72 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  49.44 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  57.33 
 
 		 183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  50.54 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  51.1 
 
 		 174 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  55.56 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  56.08 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  54.86 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  43.24 
 
 		 245 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  42.11 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  42.78 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  44.97 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  46 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  46 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  42.41 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  41.53 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  45.03 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  42.53 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  38.83 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  39.25 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  44.59 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  36.02 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  39.35 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  42.48 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  43.33 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  44 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  40.97 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  36.9 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  37.99 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  39.29 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  37.91 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  33.16 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  29.72 
 
 		 367 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  32.35 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  35.77 
 
 		 113 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  25.19 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  28.95 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  30.22 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  30.22 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  27.61 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  47.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  31.5 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 		 616 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  26.14 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  24.82 
 
 		 391 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  37.04 
 
 		 539 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>