53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2687 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  78.48 
 
 
197 aa  248  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  76.58 
 
 
197 aa  244  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  76.58 
 
 
197 aa  244  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  76.73 
 
 
187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  76.13 
 
 
194 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  60.49 
 
 
192 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  60.39 
 
 
177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  48.63 
 
 
174 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  45.9 
 
 
174 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  46.56 
 
 
185 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  47.83 
 
 
176 aa  157  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  49.09 
 
 
181 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  50.6 
 
 
175 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  49.39 
 
 
245 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  52.7 
 
 
183 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  45.05 
 
 
174 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  48.45 
 
 
190 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  52.05 
 
 
137 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  44.58 
 
 
179 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  40.64 
 
 
179 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  43.75 
 
 
179 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  39.46 
 
 
183 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  41.22 
 
 
185 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  38.17 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  41.18 
 
 
199 aa  130  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  40.33 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  42.01 
 
 
239 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  42.58 
 
 
191 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  42.58 
 
 
203 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  35.96 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  43.42 
 
 
197 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  35.64 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  39.33 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  41.72 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  38.89 
 
 
188 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  36.54 
 
 
160 aa  98.2  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  31.38 
 
 
177 aa  95.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  36.88 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  48.15 
 
 
367 aa  84.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  32.61 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  34.11 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  24.82 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  29.5 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  30.95 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  24.5 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  37.04 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  29.82 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  29.82 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  32.31 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  24.84 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  24.07 
 
 
556 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>