More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3545 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  63.35 
 
 
679 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
681 aa  1358    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  69.85 
 
 
689 aa  894    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 
719 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 
721 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  38.51 
 
 
688 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 
751 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
715 aa  363  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 
709 aa  362  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  38.17 
 
 
716 aa  346  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 
732 aa  343  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  34.42 
 
 
716 aa  340  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 
712 aa  330  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  34.7 
 
 
686 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  36.35 
 
 
692 aa  323  7e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  36.58 
 
 
727 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 
708 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 
692 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  38.2 
 
 
706 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 
698 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
698 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
722 aa  267  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  31.41 
 
 
699 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  31.64 
 
 
699 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  35.19 
 
 
408 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.85 
 
 
756 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
715 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
715 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
747 aa  117  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.9 
 
 
386 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
395 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
530 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.37 
 
 
375 aa  96.3  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  25 
 
 
764 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
614 aa  93.6  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 
614 aa  93.6  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  29.06 
 
 
387 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.07 
 
 
385 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.57 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.57 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.57 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.68 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.57 
 
 
387 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.96 
 
 
387 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.68 
 
 
387 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.68 
 
 
387 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.96 
 
 
387 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  24.73 
 
 
715 aa  90.5  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 
396 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  24.55 
 
 
614 aa  88.2  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
412 aa  88.2  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
611 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.4 
 
 
375 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  28.24 
 
 
375 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  24.27 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
674 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.18 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 
404 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.13 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.18 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.61 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.18 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.72 
 
 
609 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  28.68 
 
 
375 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  28.02 
 
 
562 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.94 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.94 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  22.2 
 
 
775 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.68 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  22.98 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.68 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.93 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  28.22 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.68 
 
 
375 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.47 
 
 
567 aa  77  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
482 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.47 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.47 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.47 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 
567 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.43 
 
 
670 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.47 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.47 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.68 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.38 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  24.32 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>