More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0659 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  61.81 
 
 
510 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
497 aa  1017    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
499 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 
491 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  64.67 
 
 
489 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 
503 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
499 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
494 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 
494 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
501 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
501 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 
499 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
488 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
499 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 
489 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
499 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
499 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 
489 aa  612  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 
499 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
499 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
493 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
515 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
515 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
495 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 
631 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
561 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
508 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
573 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
491 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  55.42 
 
 
491 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
509 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  54 
 
 
573 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
494 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
504 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
494 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
492 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
505 aa  547  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
573 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
496 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
492 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
492 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
503 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
503 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.95 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
508 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.95 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
504 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
505 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
504 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
505 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
502 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
494 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
494 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
505 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
505 aa  532  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
495 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
496 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
505 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
502 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 
511 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 
488 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
512 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
501 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
512 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.84 
 
 
499 aa  525  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
513 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
513 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
505 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
505 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
512 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>