More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1120 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 335 aa  666    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  37.65 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  37.65 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  34.74 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  36.97 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  33.13 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.15 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  34.53 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.23 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  34.23 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.23 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.23 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35.37 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.55 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.63 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.63 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  34.12 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  32.55 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  34.28 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.65 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  30.96 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.4 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.32 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  33.02 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  34.05 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  31.25 
 
 		 354 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  30.58 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.68 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.28 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.03 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.12 
 
 		 509 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  30.72 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  30.72 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.88 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.53 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.89 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.27 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.27 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.27 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.43 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.35 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.02 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.7 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.25 
 
 		 397 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  27.84 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.31 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.09 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  27.83 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.34 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  33.54 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.85 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.89 
 
 		 375 aa  109  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  30.36 
 
 		 366 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.65 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  27.3 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.65 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.13 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  34.75 
 
 		 146 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.23 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 531 aa  97.8  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 542 aa  96.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 402 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 402 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  31.78 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  31.78 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  31.31 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.43 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.36 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.66 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  31.08 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  29.38 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  29.38 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>