More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0457 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  79.1 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  80.6 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  76.87 
 
 		 140 aa  206  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  78.36 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  76.12 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 151 aa  204  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 145 aa  204  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 137 aa  200  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  77.1 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 137 aa  199  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  75.37 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  73.28 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  78.36 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 126 aa  193  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 126 aa  193  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  76.69 
 
 		 137 aa  193  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 140 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  71.22 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  71.64 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  74.63 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  71.64 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  73.88 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  72.39 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 133 aa  186  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 124 aa  185  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 127 aa  184  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  70.15 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  68.66 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 125 aa  183  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  73.13 
 
 		 125 aa  183  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  69.4 
 
 		 134 aa  183  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>