More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0087 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  100 
 
 
369 aa  721  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  29.18 
 
 
379 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.34 
 
 
386 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.54 
 
 
477 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
377 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
489 aa  149  1e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
406 aa  147  4e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
469 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
477 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.46 
 
 
518 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
496 aa  141  2e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
459 aa  140  4e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.62888e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31 
 
 
463 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  28.85 
 
 
477 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
471 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
452 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
475 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
472 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  29.03 
 
 
480 aa  136  6e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  25.8 
 
 
462 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.81 
 
 
468 aa  134  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
477 aa  134  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  26.69 
 
 
501 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
441 aa  132  7e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
462 aa  132  8e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  32.62 
 
 
444 aa  132  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  25.84 
 
 
469 aa  132  1e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
469 aa  131  2e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
469 aa  131  2e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
350 aa  131  2e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  28.76 
 
 
490 aa  131  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.98579e-06  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
448 aa  131  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
469 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  28.72 
 
 
468 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  27.87 
 
 
449 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
484 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  35.5 
 
 
437 aa  130  4e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
471 aa  130  4e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
500 aa  130  4e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  31.58 
 
 
455 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
455 aa  129  7e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
470 aa  129  8e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  27.21 
 
 
483 aa  129  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
472 aa  129  1e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  32.29 
 
 
463 aa  129  1e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
458 aa  128  1e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.92 
 
 
461 aa  129  1e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
456 aa  129  1e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  29.17 
 
 
481 aa  128  1e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
418 aa  128  2e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  27.4 
 
 
446 aa  128  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
458 aa  128  2e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
458 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
458 aa  128  2e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
495 aa  128  2e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  31.6 
 
 
443 aa  128  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
458 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
382 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.16 
 
 
481 aa  127  4e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  4.23782e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  29.12 
 
 
480 aa  127  4e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  25.96 
 
 
438 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  27.4 
 
 
357 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
447 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
458 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  26.73 
 
 
482 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
476 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
357 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  1.35665e-14 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.84 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
470 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
484 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  26.25 
 
 
483 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
478 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
469 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.08474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.2 
 
 
397 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.48 
 
 
459 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
433 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.77 
 
 
458 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
469 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.77 
 
 
458 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
479 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  26.89 
 
 
483 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.85 
 
 
477 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
445 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  31.3 
 
 
501 aa  124  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.26 
 
 
351 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
500 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
453 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  26.97 
 
 
431 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
445 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  25 
 
 
467 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
392 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
416 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
458 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>