More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0064 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  100 
 
 
380 aa  775  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.86 
 
 
369 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
369 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.43 
 
 
372 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.74 
 
 
384 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.27 
 
 
370 aa  371  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.16 
 
 
370 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  51.37 
 
 
365 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.09 
 
 
370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  50.55 
 
 
366 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
366 aa  362  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
366 aa  362  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
374 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50.68 
 
 
374 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.37 
 
 
370 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.94 
 
 
372 aa  358  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
370 aa  358  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.2 
 
 
360 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51.08 
 
 
367 aa  355  8e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51.08 
 
 
367 aa  355  8e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.77 
 
 
365 aa  355  9e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  49.19 
 
 
392 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
380 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.95 
 
 
364 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50 
 
 
367 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  50.27 
 
 
371 aa  353  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.82 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.82 
 
 
364 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
360 aa  353  3e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.14 
 
 
369 aa  353  3e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
360 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.95 
 
 
364 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  49.59 
 
 
365 aa  352  6e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  49.59 
 
 
365 aa  352  6e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  50.82 
 
 
364 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  6.22253e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  52.04 
 
 
360 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  52.04 
 
 
360 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  52.04 
 
 
360 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  51.23 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
366 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.73 
 
 
368 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50.28 
 
 
357 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  48.48 
 
 
368 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.44 
 
 
380 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  50 
 
 
363 aa  349  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
360 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  47.98 
 
 
373 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.92 
 
 
380 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
366 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.45 
 
 
366 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  7.4393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  49.46 
 
 
369 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  47.14 
 
 
371 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.37 
 
 
367 aa  346  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.37 
 
 
367 aa  346  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  49.59 
 
 
359 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
359 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  48.79 
 
 
402 aa  344  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  49.44 
 
 
359 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.51 
 
 
367 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.07 
 
 
385 aa  343  3e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  46.57 
 
 
426 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.24 
 
 
367 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  55.25 
 
 
369 aa  342  6e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0776  ABC transporter related  48.81 
 
 
377 aa  342  6e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  47.9 
 
 
357 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 
377 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  49.02 
 
 
368 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  49.19 
 
 
369 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  49.02 
 
 
368 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  46.91 
 
 
380 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  46.29 
 
 
405 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  48.73 
 
 
359 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
371 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  47.5 
 
 
359 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  44.08 
 
 
398 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  46.29 
 
 
405 aa  339  6e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  46.29 
 
 
405 aa  339  6e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
393 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  48.58 
 
 
382 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  48.77 
 
 
355 aa  338  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.30486e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  44.72 
 
 
364 aa  338  1e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  47.09 
 
 
377 aa  338  1e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.28 
 
 
402 aa  337  2e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  47.96 
 
 
367 aa  337  2e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.11 
 
 
366 aa  336  3e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.25 
 
 
381 aa  337  3e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 
369 aa  337  3e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
371 aa  337  3e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
372 aa  336  4e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  48.88 
 
 
369 aa  336  4e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.89 
 
 
369 aa  336  4e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  47.03 
 
 
371 aa  336  4e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
367 aa  336  4e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>