More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0017 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
658 aa  1333  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
338 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.81 
 
 
284 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.31 
 
 
306 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.31 
 
 
306 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  44.92 
 
 
307 aa  228  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
307 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.92 
 
 
307 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
307 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 
307 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 
304 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  44.71 
 
 
307 aa  223  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  45.78 
 
 
282 aa  221  2e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
352 aa  222  2e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.31 
 
 
307 aa  222  2e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  43.91 
 
 
304 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 
304 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.92 
 
 
307 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
299 aa  221  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  43.92 
 
 
307 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  45.65 
 
 
288 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
316 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
280 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.11 
 
 
280 aa  215  2e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
280 aa  214  5e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
285 aa  214  5e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.79 
 
 
372 aa  214  6e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  1.67593e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
371 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
355 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
371 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
468 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
376 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
285 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
603 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
867 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
378 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
258 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 
293 aa  202  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 
293 aa  202  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0854715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
532 aa  201  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
293 aa  200  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  2.96229e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  39.56 
 
 
351 aa  200  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
497 aa  199  1e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
558 aa  198  2e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
495 aa  197  4e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
323 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  41.33 
 
 
283 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
283 aa  195  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 
283 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.82842e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  41.78 
 
 
283 aa  195  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
364 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.33 
 
 
283 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
363 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
485 aa  194  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  41.33 
 
 
283 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
283 aa  194  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
283 aa  194  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
283 aa  194  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
305 aa  193  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  41.78 
 
 
300 aa  193  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
496 aa  193  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  40.17 
 
 
371 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
330 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.188792  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  41.85 
 
 
479 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
494 aa  191  3e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
300 aa  191  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
284 aa  191  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
287 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  6.42732e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
285 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
360 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  41.85 
 
 
473 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
310 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
307 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
334 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
292 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
300 aa  186  1e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  36.3 
 
 
301 aa  186  1e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.05 
 
 
302 aa  186  1e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
334 aa  185  2e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
516 aa  185  2e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
292 aa  186  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0568  oligopeptide ABC transporter, permease  39.47 
 
 
301 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
391 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
301 aa  184  5e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  38.27 
 
 
302 aa  184  5e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.56 
 
 
300 aa  184  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
300 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
299 aa  183  8e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
308 aa  183  8e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
278 aa  183  9e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
367 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
367 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
300 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40 
 
 
394 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
349 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
301 aa  181  3e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
310 aa  180  6e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
313 aa  180  6e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
387 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
312 aa  180  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>