More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1175 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  66.11 
 
 		 178 aa  255  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  66.67 
 
 		 176 aa  254  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  62.57 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  50.54 
 
 		 266 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  52 
 
 		 243 aa  187  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  51.98 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  48.66 
 
 		 306 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  48.35 
 
 		 266 aa  184  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 273 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  48.4 
 
 		 250 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  51.69 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  50 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  47.8 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.02 
 
 		 173 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  48.62 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  46.28 
 
 		 267 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  47.8 
 
 		 277 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  46.67 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  47.16 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  48.89 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 272 aa  174  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  44.5 
 
 		 272 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  46.59 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.4 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  45.16 
 
 		 280 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  46.6 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  44.79 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  44.79 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  43.94 
 
 		 266 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  44.79 
 
 		 271 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  47.54 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  49.16 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 246 aa  170  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  50.85 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  49.14 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  44.1 
 
 		 276 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  43.85 
 
 		 265 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  46.99 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.57 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  44.27 
 
 		 299 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  48.07 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  48.07 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  50.85 
 
 		 174 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  49.72 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  49.15 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  44.26 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  48.89 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  44.39 
 
 		 301 aa  165  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  49.16 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  49.16 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  46.67 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  46.67 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  46.33 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.6 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  47.46 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.07 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.15 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  45.76 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  46.41 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  46.07 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  48.89 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  47.19 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>