More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1162 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 166 aa  350  5e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  53.64 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  54.48 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1164  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000978819  hitchhiker  1.39991e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  43.54 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.94 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.27 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 		 155 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  40.94 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  36.18 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.82 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.06 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  38.06 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  38.82 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.06 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.06 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.06 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.42 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.16 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  35.33 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.75 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  36.71 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.71 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  38.26 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  37.09 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 163 aa  98.2  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  34.87 
 
 		 157 aa  97.1  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  30.72 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  32.9 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  37.93 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  37.24 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  33.11 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.26 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  32.03 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  32.65 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.26 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  30.52 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.45 
 
 		 453 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  37.98 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.37 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.77 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  28.83 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.44 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  28.4 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>