More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0439 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 		 859 aa  873    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 		 891 aa  741    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.25 
 
 		 798 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 867 aa  1764    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 		 760 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 		 758 aa  678    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 		 818 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  45.52 
 
 		 839 aa  754    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.52 
 
 		 905 aa  892    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  46.67 
 
 		 810 aa  718    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 889 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  48.55 
 
 		 889 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 		 894 aa  703    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  55.05 
 
 		 925 aa  961    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  46.8 
 
 		 742 aa  664    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  45.34 
 
 		 797 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  46.01 
 
 		 837 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.12 
 
 		 805 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 798 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 824 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 798 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.3 
 
 		 827 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.34 
 
 		 837 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 		 753 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 837 aa  618  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.67 
 
 		 821 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 836 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 743 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.35 
 
 		 868 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.93 
 
 		 797 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  44.99 
 
 		 750 aa  614  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 		 752 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 759 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 831 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 759 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 		 786 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  43.06 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.66 
 
 		 836 aa  604  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.15 
 
 		 833 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.18 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  42.91 
 
 		 805 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  41.92 
 
 		 744 aa  597  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 		 802 aa  598  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 		 802 aa  598  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 		 806 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.63 
 
 		 838 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  42.78 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 806 aa  595  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  42.78 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  42.24 
 
 		 750 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  42.78 
 
 		 805 aa  592  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 		 815 aa  592  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  42.78 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.69 
 
 		 814 aa  592  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.77 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.52 
 
 		 796 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  44.56 
 
 		 839 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 		 837 aa  585  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  43.34 
 
 		 747 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 		 840 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 762 aa  582  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 		 905 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.8 
 
 		 841 aa  582  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 762 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 767 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 762 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 		 936 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 		 762 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.5 
 
 		 794 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  41.83 
 
 		 828 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 		 833 aa  575  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  43.12 
 
 		 782 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  42.51 
 
 		 828 aa  572  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 759 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  43.2 
 
 		 827 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 852 aa  572  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  43.2 
 
 		 799 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 		 826 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  43.71 
 
 		 841 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.59 
 
 		 803 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  41.98 
 
 		 828 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 942 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 804 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  41.97 
 
 		 750 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  42.58 
 
 		 759 aa  568  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 		 754 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.01 
 
 		 835 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.18 
 
 		 819 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 857 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.2 
 
 		 833 aa  565  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 		 817 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 		 838 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41 
 
 		 844 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.37 
 
 		 954 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  39.97 
 
 		 758 aa  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.48 
 
 		 826 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  42.8 
 
 		 747 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 		 778 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 797 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>