More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0531 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  100 
 
 		 429 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  50.37 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.34 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.39 
 
 		 395 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.81 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  46.82 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  48.25 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  51.66 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  41.18 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 624 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  55.1 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  45 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  44.8 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.27 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  40.12 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  38.71 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  49.25 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  47.89 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  46.18 
 
 		 434 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  43.46 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  44.81 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  43.13 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  46.15 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  48.96 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  48.1 
 
 		 374 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 621 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  43.95 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.93 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  44.75 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  43.89 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.27 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  45.18 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  43.58 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  44.6 
 
 		 580 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  41.21 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  49.28 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  46.92 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.31 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  42.6 
 
 		 237 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  39.24 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 398 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  41.73 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 725 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  39.11 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  37.47 
 
 		 419 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  36.53 
 
 		 453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 618 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1464  putative signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.29 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.63 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 723 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  35.35 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  40.21 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>