More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1370 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
333 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  80.75 
 
 
340 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  69.54 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  44.61 
 
 
310 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  50.85 
 
 
325 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  47.54 
 
 
298 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  51.76 
 
 
325 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  48.56 
 
 
312 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  47.08 
 
 
312 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  47.08 
 
 
312 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  45.96 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  46.03 
 
 
312 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  45.95 
 
 
327 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.39 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  44.13 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  43.81 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  44.13 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  44.13 
 
 
312 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  45.07 
 
 
316 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  40.07 
 
 
299 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  43.81 
 
 
312 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  40.07 
 
 
299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  47.44 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 
327 aa  233  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  38.97 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 
305 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 
305 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.39 
 
 
299 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  40.07 
 
 
299 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.07 
 
 
299 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.41 
 
 
299 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.41 
 
 
299 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 
325 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  38.48 
 
 
398 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  38.85 
 
 
298 aa  223  3e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.77 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.71 
 
 
306 aa  222  8e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  39.34 
 
 
305 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  39.71 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.44 
 
 
299 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.04 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  44.24 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 
305 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
299 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.86 
 
 
315 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 
312 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
307 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 
300 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
316 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.07 
 
 
316 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 
313 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 
302 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  44.09 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  44.09 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  44.09 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  44.09 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  44.09 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  44.09 
 
 
313 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  44.09 
 
 
313 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  38.44 
 
 
299 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 
300 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.54 
 
 
300 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
325 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
325 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 
305 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
307 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  38.03 
 
 
317 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  39.38 
 
 
378 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 
321 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 
339 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 
305 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.05 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
304 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.05 
 
 
297 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
305 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
297 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 
359 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 
317 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 
311 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
326 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36 
 
 
304 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
323 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  41.44 
 
 
626 aa  178  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  37.59 
 
 
316 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  37.96 
 
 
316 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  38.11 
 
 
306 aa  176  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  39.37 
 
 
343 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>