167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0230 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  100 
 
 		 204 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  50 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  53.48 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  47.22 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  44.55 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.85 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  46.94 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  48.5 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  56.59 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  44.58 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  46.77 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  49.46 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  47.93 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  43.5 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  44.39 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  45.62 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  52.78 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  43.53 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  46.25 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  32.11 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  40.82 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  50.69 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  42.11 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.29 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  35.76 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  37.2 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  38.41 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  40 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  37.04 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.55 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  43.57 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  44.29 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  39.78 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  41.61 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  35 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  38.41 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.51 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.16 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  43.05 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.77 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  42.76 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  41.76 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.78 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  42.26 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  34.76 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  35.54 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.97 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  40.26 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  40.4 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  41.94 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.39 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  32.88 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  38.62 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.54 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  42.03 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  37.06 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  31.47 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  28.07 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  31.79 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  41.1 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.88 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.61 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  30.72 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  33.33 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  35.33 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  36.97 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.73 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.18 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.25 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.78 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.46 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.46 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.08 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  32.14 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  32.87 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  32.8 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  36.31 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  32.8 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  31.25 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30.14 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.53 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.17 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.17 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  33.57 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  33.71 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  34.42 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  30.36 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  34.62 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  45.57 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  28.14 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  29.93 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.57 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  30.61 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.77 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  35.06 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  32.98 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  34.97 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  31.85 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>