75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4184 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  94.81 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  94.16 
 
 		 154 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  71.43 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  32.79 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  38.75 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  39.33 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  33.86 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  34.88 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  31.4 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  29.47 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  31.65 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  30.38 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  29.11 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  35.8 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  31.3 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  34.57 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  34.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  34.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  36.25 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  44.23 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  28.83 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  53.06 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  38.81 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  35.38 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  35.38 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  24.68 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  32.05 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  35.58 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  27.54 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  32.63 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  30.26 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  37.7 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  34.78 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  45.28 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  37.31 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  36.59 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  36.59 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  36.59 
 
 		 217 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.77 
 
 		 386 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  31.11 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  42.31 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  41.46 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  44.74 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  34.69 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  36.92 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  35.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  46.81 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>