More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1293 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
441 aa  897    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  75.17 
 
 
443 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.86 
 
 
449 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.04 
 
 
435 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.86 
 
 
433 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.72 
 
 
432 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.13 
 
 
425 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.29 
 
 
446 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  56.43 
 
 
429 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.01 
 
 
421 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.56 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  55.48 
 
 
424 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.76 
 
 
419 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  58.02 
 
 
435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  56.73 
 
 
417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.35 
 
 
417 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.74 
 
 
435 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.35 
 
 
417 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.4 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.88 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.57 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.76 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.1 
 
 
421 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.7 
 
 
441 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  55.21 
 
 
425 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.58 
 
 
442 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  53.26 
 
 
441 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  49.53 
 
 
421 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  50.36 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  46.45 
 
 
423 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  46.67 
 
 
420 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  47.31 
 
 
429 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 
411 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.71 
 
 
428 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.73 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.98 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.45 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.06 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.2 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.14 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.32 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  47.96 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.61 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.62 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  45.71 
 
 
420 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45 
 
 
419 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.24 
 
 
419 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  48.33 
 
 
424 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.63 
 
 
419 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.53 
 
 
414 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.86 
 
 
412 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.13 
 
 
406 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.35 
 
 
414 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.13 
 
 
406 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.13 
 
 
406 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.73 
 
 
406 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.58 
 
 
406 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.13 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.05 
 
 
408 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.58 
 
 
404 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  44.89 
 
 
406 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  46.32 
 
 
419 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  44.89 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.66 
 
 
406 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.58 
 
 
435 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  44.89 
 
 
406 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.75 
 
 
408 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  44.29 
 
 
417 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  46.06 
 
 
434 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  44.66 
 
 
406 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.82 
 
 
409 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.15 
 
 
414 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 
406 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  44.66 
 
 
406 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.1 
 
 
414 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.76 
 
 
417 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.49 
 
 
408 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.81 
 
 
413 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.81 
 
 
413 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
409 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.63 
 
 
410 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.57 
 
 
451 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.92 
 
 
662 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  44.63 
 
 
419 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.86 
 
 
412 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.99 
 
 
415 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.21 
 
 
657 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  45.15 
 
 
496 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.29 
 
 
415 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  43.1 
 
 
413 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  45.61 
 
 
428 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
426 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.28 
 
 
644 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.94 
 
 
604 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  43.94 
 
 
604 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.28 
 
 
629 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.02 
 
 
674 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.65 
 
 
413 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.02 
 
 
672 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.44 
 
 
425 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>