65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2071 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  82.71 
 
 
271 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  78.65 
 
 
267 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  79.4 
 
 
267 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  36.88 
 
 
265 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  39.69 
 
 
265 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  36.76 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  31.3 
 
 
258 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  32.93 
 
 
258 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  31.5 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  35.38 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  35.63 
 
 
262 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  41.63 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  35.89 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  32.53 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  33.72 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.25 
 
 
261 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  32.55 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.33 
 
 
266 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  27.75 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  29.34 
 
 
281 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  33.96 
 
 
267 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  23.6 
 
 
270 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  22.3 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  24.18 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  27.98 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  23.44 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  30 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  23.05 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  23.11 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  23.05 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  23.05 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  23.05 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  23.05 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  22.35 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.3 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  21.4 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  22.3 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  20.51 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  24.35 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  23.53 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  23.78 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  23.08 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  28.09 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.11 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  23.24 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  23.42 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  21.78 
 
 
260 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  23.04 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  23.04 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.69 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  23.83 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  23.98 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  33.8 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  33 
 
 
165 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  26.82 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  19.34 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  21.23 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  25.44 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  21.23 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>