More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0666 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  82.59 
 
 
225 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  82.59 
 
 
225 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  82.38 
 
 
230 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  74.55 
 
 
230 aa  342  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  77 
 
 
228 aa  332  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  67.21 
 
 
255 aa  330  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  42.79 
 
 
216 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  41.35 
 
 
233 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  44.78 
 
 
225 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  44.02 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 
207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  39.11 
 
 
210 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  45.54 
 
 
787 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  43.14 
 
 
225 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  39.6 
 
 
210 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 
236 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  38.35 
 
 
214 aa  153  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  37.95 
 
 
211 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  38.14 
 
 
211 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  38.14 
 
 
211 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  37.69 
 
 
200 aa  151  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
210 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  37.83 
 
 
228 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  39.9 
 
 
234 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  40.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 
209 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.44 
 
 
209 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  37.62 
 
 
213 aa  148  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  40.87 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  37.8 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  40.61 
 
 
255 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  40.8 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  35.44 
 
 
228 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  35.44 
 
 
228 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  40.58 
 
 
267 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  40.58 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  38.43 
 
 
248 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  38.92 
 
 
210 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.2 
 
 
218 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  41.18 
 
 
235 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  39.41 
 
 
227 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  39.44 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  38.31 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  41.62 
 
 
231 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  36.84 
 
 
214 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  37.2 
 
 
214 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  38.42 
 
 
217 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  40.2 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  39.71 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  38.38 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  36.32 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  39.71 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  38.65 
 
 
242 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  36.67 
 
 
218 aa  138  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  38.46 
 
 
239 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  38.46 
 
 
239 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  38.14 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  38.46 
 
 
239 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  40.29 
 
 
214 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  37.68 
 
 
278 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  38.65 
 
 
242 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.81 
 
 
207 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  39.49 
 
 
239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  39.9 
 
 
225 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  40.96 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  37.38 
 
 
221 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  34.74 
 
 
214 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  39.58 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  38.42 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  40 
 
 
201 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
246 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.1 
 
 
225 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  39.9 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  37.68 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  35.58 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.54 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
219 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.05 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.35 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  34.76 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  37.2 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  34.8 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  36.45 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  38.05 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  48.15 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.05 
 
 
219 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  37.98 
 
 
219 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  35.94 
 
 
219 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  36.89 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  39.02 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  36.41 
 
 
739 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>