39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0161 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 		 353 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  66.28 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  64.66 
 
 		 349 aa  484  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  65.41 
 
 		 345 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  64.84 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  61.11 
 
 		 357 aa  434  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  59.04 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  52.81 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  53.15 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  48.16 
 
 		 353 aa  345  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  48.86 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  44.32 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  40.34 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  58.14 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  39.11 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  37.74 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  38.31 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  37.29 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  34.53 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  35.56 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  47.33 
 
 		 150 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  44.07 
 
 		 136 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  42.19 
 
 		 242 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  30.86 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  31.34 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  29.05 
 
 		 163 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.45 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  32.35 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  26.76 
 
 		 152 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  26.92 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  25.83 
 
 		 165 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  28.15 
 
 		 167 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  24.14 
 
 		 161 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  25.49 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  27.45 
 
 		 156 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  31.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>