23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2786 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  28.91 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  26.76 
 
 		 353 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  26.03 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  28.26 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  32.24 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  26.4 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  27.27 
 
 		 345 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  25 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  28.38 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  26.19 
 
 		 351 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  26.77 
 
 		 331 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  26.57 
 
 		 351 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  25.87 
 
 		 356 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  25.4 
 
 		 362 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  26.71 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2930  Appr-1-p processing domain protein  23.19 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00352819  hitchhiker  0.00887383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  27.78 
 
 		 397 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  27.48 
 
 		 355 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  25.52 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  22.76 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0497  protein of unknown function DUF955  26.76 
 
 		 475 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000656756  hitchhiker  0.00190239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>